MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Borrelia burgdorferi N40 plasmid N40_lp28-2

Total Repeats: 572

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017419	GTTT	2	8	269	276	0 %	75 %	25 %	0 %	387827739
2	NC_017419	TA	3	6	278	283	50 %	50 %	0 %	0 %	387827739
3	NC_017419	ATT	2	6	285	290	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387827739
4	NC_017419	GGA	2	6	295	300	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387827739
5	NC_017419	A	7	7	347	353	100 %	0 %	0 %	0 %	387827739
6	NC_017419	AAT	2	6	358	363	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827739
7	NC_017419	AAG	2	6	368	373	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387827739
8	NC_017419	AAG	2	6	389	394	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387827739
9	NC_017419	TA	3	6	410	415	50 %	50 %	0 %	0 %	387827739
10	NC_017419	A	6	6	431	436	100 %	0 %	0 %	0 %	387827739
11	NC_017419	TAAT	2	8	476	483	50 %	50 %	0 %	0 %	387827739
12	NC_017419	A	8	8	560	567	100 %	0 %	0 %	0 %	387827739
13	NC_017419	AGG	2	6	578	583	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387827739
14	NC_017419	CTA	2	6	596	601	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387827739
15	NC_017419	GAA	2	6	604	609	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387827739
16	NC_017419	TGA	2	6	618	623	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387827739
17	NC_017419	AGA	2	6	639	644	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387827739
18	NC_017419	TTC	2	6	650	655	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387827739
19	NC_017419	AATT	2	8	674	681	50 %	50 %	0 %	0 %	387827739
20	NC_017419	AAG	2	6	683	688	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387827739
21	NC_017419	TAA	2	6	716	721	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827739
22	NC_017419	ATG	2	6	734	739	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387827739
23	NC_017419	A	7	7	760	766	100 %	0 %	0 %	0 %	387827739
24	NC_017419	CAT	2	6	767	772	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387827739
25	NC_017419	AGATA	2	10	798	807	60 %	20 %	20 %	0 %	387827739
26	NC_017419	AAT	2	6	829	834	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827739
27	NC_017419	AGC	2	6	857	862	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387827739
28	NC_017419	TGAT	2	8	872	879	25 %	50 %	25 %	0 %	387827739
29	NC_017419	CTTT	2	8	908	915	0 %	75 %	0 %	25 %	387827739
30	NC_017419	T	6	6	913	918	0 %	100 %	0 %	0 %	387827739
31	NC_017419	TAT	2	6	948	953	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387827739
32	NC_017419	AG	3	6	963	968	50 %	0 %	50 %	0 %	387827739
33	NC_017419	ATA	2	6	974	979	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827739
34	NC_017419	TTA	2	6	984	989	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387827739
35	NC_017419	AAG	2	6	1026	1031	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387827739
36	NC_017419	AAGA	2	8	1083	1090	75 %	0 %	25 %	0 %	387827739
37	NC_017419	A	7	7	1090	1096	100 %	0 %	0 %	0 %	387827739
38	NC_017419	TTA	2	6	1106	1111	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387827739
39	NC_017419	A	6	6	1144	1149	100 %	0 %	0 %	0 %	387827739
40	NC_017419	AAAT	2	8	1194	1201	75 %	25 %	0 %	0 %	387827740
41	NC_017419	TAAAT	2	10	1210	1219	60 %	40 %	0 %	0 %	387827740
42	NC_017419	AAT	2	6	1229	1234	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827740
43	NC_017419	T	8	8	1242	1249	0 %	100 %	0 %	0 %	387827740
44	NC_017419	CTA	2	6	1275	1280	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387827740
45	NC_017419	ATA	2	6	1290	1295	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827740
46	NC_017419	G	6	6	1320	1325	0 %	0 %	100 %	0 %	387827740
47	NC_017419	AAT	2	6	1348	1353	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827740
48	NC_017419	ATA	2	6	1377	1382	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827740
49	NC_017419	TAA	2	6	1389	1394	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827740
50	NC_017419	CAA	2	6	1395	1400	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387827740
51	NC_017419	ATT	2	6	1463	1468	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387827740
52	NC_017419	TA	3	6	1493	1498	50 %	50 %	0 %	0 %	387827740
53	NC_017419	AAG	2	6	1500	1505	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387827740
54	NC_017419	GA	3	6	1520	1525	50 %	0 %	50 %	0 %	387827740
55	NC_017419	A	6	6	1529	1534	100 %	0 %	0 %	0 %	387827740
56	NC_017419	AAAT	2	8	1546	1553	75 %	25 %	0 %	0 %	387827740
57	NC_017419	A	6	6	1583	1588	100 %	0 %	0 %	0 %	387827740
58	NC_017419	AGA	2	6	1597	1602	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387827740
59	NC_017419	ATT	2	6	1688	1693	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387827740
60	NC_017419	GTT	2	6	1769	1774	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387827740
61	NC_017419	CAA	2	6	1776	1781	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387827740
62	NC_017419	AAAAC	2	10	1828	1837	80 %	0 %	0 %	20 %	387827740
63	NC_017419	T	6	6	1854	1859	0 %	100 %	0 %	0 %	387827740
64	NC_017419	A	6	6	1862	1867	100 %	0 %	0 %	0 %	387827740
65	NC_017419	TTA	2	6	1905	1910	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387827740
66	NC_017419	ACTAT	2	10	1932	1941	40 %	40 %	0 %	20 %	387827740
67	NC_017419	ACTTA	2	10	1968	1977	40 %	40 %	0 %	20 %	387827740
68	NC_017419	AAG	2	6	2004	2009	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387827740
69	NC_017419	TCA	2	6	2028	2033	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387827740
70	NC_017419	A	8	8	2061	2068	100 %	0 %	0 %	0 %	387827740
71	NC_017419	TAATAT	2	12	2237	2248	50 %	50 %	0 %	0 %	387827741
72	NC_017419	A	7	7	2250	2256	100 %	0 %	0 %	0 %	387827741
73	NC_017419	ATTAAT	2	12	2264	2275	50 %	50 %	0 %	0 %	387827741
74	NC_017419	GTG	3	9	2446	2454	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387827741
75	NC_017419	ACT	2	6	2456	2461	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387827741
76	NC_017419	GGA	2	6	2478	2483	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387827741
77	NC_017419	AGG	2	6	2513	2518	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387827741
78	NC_017419	TAA	2	6	2551	2556	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827741
79	NC_017419	GGA	2	6	2559	2564	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387827741
80	NC_017419	TAT	2	6	2566	2571	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387827741
81	NC_017419	AGG	2	6	2579	2584	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387827741
82	NC_017419	GCA	2	6	2595	2600	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387827741
83	NC_017419	ATT	3	9	2616	2624	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387827741
84	NC_017419	A	7	7	2661	2667	100 %	0 %	0 %	0 %	387827741
85	NC_017419	A	6	6	2739	2744	100 %	0 %	0 %	0 %	387827741
86	NC_017419	TAA	3	9	3095	3103	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827742
87	NC_017419	ACT	2	6	3154	3159	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387827742
88	NC_017419	ACT	2	6	3211	3216	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387827742
89	NC_017419	TCTA	2	8	3241	3248	25 %	50 %	0 %	25 %	387827742
90	NC_017419	TAA	2	6	3407	3412	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827742
91	NC_017419	TCTTT	2	10	3431	3440	0 %	80 %	0 %	20 %	387827742
92	NC_017419	T	6	6	3512	3517	0 %	100 %	0 %	0 %	387827742
93	NC_017419	T	6	6	3535	3540	0 %	100 %	0 %	0 %	387827742
94	NC_017419	T	6	6	3554	3559	0 %	100 %	0 %	0 %	387827742
95	NC_017419	AATA	2	8	3560	3567	75 %	25 %	0 %	0 %	387827742
96	NC_017419	GAT	2	6	3573	3578	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387827742
97	NC_017419	ACT	2	6	3595	3600	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387827742
98	NC_017419	T	6	6	3643	3648	0 %	100 %	0 %	0 %	387827742
99	NC_017419	ATA	2	6	3706	3711	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827742
100	NC_017419	ATC	2	6	3715	3720	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387827742
101	NC_017419	CTA	3	9	3732	3740	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387827742
102	NC_017419	TA	3	6	3814	3819	50 %	50 %	0 %	0 %	387827742
103	NC_017419	T	7	7	3842	3848	0 %	100 %	0 %	0 %	387827742
104	NC_017419	ATT	2	6	3850	3855	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387827742
105	NC_017419	T	6	6	3919	3924	0 %	100 %	0 %	0 %	387827742
106	NC_017419	A	7	7	3934	3940	100 %	0 %	0 %	0 %	387827742
107	NC_017419	A	6	6	4004	4009	100 %	0 %	0 %	0 %	387827742
108	NC_017419	TTC	2	6	4015	4020	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387827742
109	NC_017419	TAA	2	6	4041	4046	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827742
110	NC_017419	ATT	2	6	4057	4062	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387827742
111	NC_017419	TAA	2	6	4067	4072	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827742
112	NC_017419	TCTT	2	8	4073	4080	0 %	75 %	0 %	25 %	387827742
113	NC_017419	T	8	8	4138	4145	0 %	100 %	0 %	0 %	387827742
114	NC_017419	AT	3	6	4159	4164	50 %	50 %	0 %	0 %	387827742
115	NC_017419	TTA	2	6	4181	4186	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387827742
116	NC_017419	ATT	2	6	4193	4198	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387827742
117	NC_017419	CAA	2	6	4413	4418	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387827743
118	NC_017419	TAA	2	6	4423	4428	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827743
119	NC_017419	A	6	6	4432	4437	100 %	0 %	0 %	0 %	387827743
120	NC_017419	CAA	2	6	4450	4455	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387827743
121	NC_017419	ACA	2	6	4459	4464	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387827743
122	NC_017419	TTC	2	6	4476	4481	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387827743
123	NC_017419	CATA	2	8	4494	4501	50 %	25 %	0 %	25 %	387827743
124	NC_017419	ATA	2	6	4512	4517	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827743
125	NC_017419	A	7	7	4527	4533	100 %	0 %	0 %	0 %	387827743
126	NC_017419	CACTA	2	10	4582	4591	40 %	20 %	0 %	40 %	387827743
127	NC_017419	AAC	2	6	4639	4644	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387827743
128	NC_017419	ACT	2	6	4647	4652	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387827743
129	NC_017419	ATT	2	6	4701	4706	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387827743
130	NC_017419	A	6	6	4709	4714	100 %	0 %	0 %	0 %	387827743
131	NC_017419	ATCA	2	8	4730	4737	50 %	25 %	0 %	25 %	387827743
132	NC_017419	A	8	8	4749	4756	100 %	0 %	0 %	0 %	387827743
133	NC_017419	TAA	2	6	4804	4809	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827743
134	NC_017419	TAA	2	6	4843	4848	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827743
135	NC_017419	ATA	3	9	4851	4859	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827743
136	NC_017419	AGA	2	6	4864	4869	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387827743
137	NC_017419	AAGA	3	12	4866	4877	75 %	0 %	25 %	0 %	387827743
138	NC_017419	TTA	2	6	4934	4939	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387827743
139	NC_017419	TTC	2	6	4947	4952	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387827743
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